Aydın 3. Asliye Ceza Mahkemesi'nde görülen ve Cuma günü sonuçlanan davada, Bircan'a çeşitli suçlamalar yöneltilmişti. Kendisinden sonra rektörlük görevine getirilen Prof. Dr. Osman Selçuk Aldemir ve rektör yardımcıları ile bazı akademisyenlerin özel hayatlarının gizliliğini ihlal etmek, kişisel verileri hukuka aykırı ele geçirmek ve yaymak suçlamalarıyla dava açılmıştı.
Mahkeme, Cuma günü görülen son duruşmada savcılığın mütalaası doğrultusunda Bircan'ı suçlu buldu ve toplamda 12 yıl 67 gün hapis cezasına çarptırdı. Ayrıca, kamu hizmetlerinden yoksun bırakılmasına da hükmedildi.
Ancak, daha önce suç kaydı bulunmaması nedeniyle mahkeme, Bircan'a verilen cezanın 3 yıl 8 aylık kısmında hükmün açıklanmasının geri bırakılmasına karar verdi ve 5 yıl adli kontrol hükümleri uygulanmasına hükmetti.
Aynı davada Bircan ile birlikte yargılanan ve Bircan tarafından azmettirildiği iddia edilen Ayla Ekin Deniz'e 2 yıl, 13 ay, 15 gün, Suat Deniz'e ise 2 yıl, 1 ay hapis cezası verildi.
